集成基因组浏览器
| 版本 （自6 / 29 / 2016起） | 9 |
| 平台 | |
| 执照 | 开源 |
| 类别 | 科学的 |
| 更多信息 （访问发布者的网站） |
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评分：
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软件总览
主要特点
- 支持各种基因组格式，例如GenBank和FASTA
- 通过缩放和平移动画与数据进行交互
- 从QuickLoad站点访问和加载基因组
- 将数据转换成各种图形形式
- 通过Dropbox与协作者共享数据
- 安装插件以获得其他功能
集成基因组浏览器（IGB）是一个开放源代码程序，用于查看和探索大型基因组数据集。 您可以查看各种数据格式，与数据进行交互，创建图，将信息另存为图像以及与协作者共享数据。
IGB允许您查看注释和对齐序列中的数据。 该程序支持多种格式，例如FASTA，BAM，BEDGRAPH，BigWIG，Cytoband和GenBank。 您可以获取数据并将其转换为多种图形形式，包括用于突出显示数据差异的失配图和用于显示覆盖率的深度图。 您还可以通过IGB的缩放和平移动画与数据进行交互。
IGB使您能够从QuickLoad站点访问和加载基因组，这些站点是目录，序列和其他数据文件的简单系统，用于可视化。 IGB提供具有插件支持的高级功能，以通过使用脚本来添加功能和工作流自动化。 IGB还为您提供了共享数据的高级功能，无论是将其发布为高质量JPEG，PNG或SVG图像，还是将数据存储在Dropbox中，以使您的协作者都能访问您的项目。
IGB主要由大学研究人员，生物学家和生物信息学家使用。 它提供了用于打开各种基因组数据格式，将数据可视化为不同图形以及与协作者共享数据的高级工具。 不幸的是，该计划依赖赠款来进行持续开发，这意味着可以随时停止对应用程序的支持。 但是，对于希望探索和分析其基因组数据的用户而言，集成基因组浏览器仍然是一个功能强大的可自定义程序。
支持的文件类型
主文件扩展名
XML文件 – XML文件
Integrated Genome Browser 9使用的其他文件扩展名
| 支持的文件类型 | |
|---|---|
| 。床 | UCSC BED注释跟踪文件 |
| .DAS | DeltaMaster分析会议 |
| 。F A | FASTA格式化序列文件 |
| .FAS | FASTA序列文件 |
| .FASTA | FASTA序列文件 |
| .GB | GenBank数据文件 |
| .SGR | SGR基因组数据文件 |
| .USEQ | USeq基因组数据文件 |
更新：六月29，2016